黄药师一开始本来要去找欧阳锋报仇的，结果柯镇恶差点说出一个关于郭靖的大秘密，这个秘密最终还是被黄药师发现，把黄药师惹恼了，就暂时没去找欧阳锋报仇。
到后来欧阳锋逆练九阴真经，武功已经超越黄药师，黄药师就不敢去报仇了，说到底，黄药师有点欺软怕硬。
梅超风跟黄药师的情感纠纷，导致她最终惨死在欧阳锋蛤蟆功下。
黄药师桃花岛共有六大弟子，即曲灵风、陈玄风、梅超风、陆乘风、武罡风、冯默风，其中曲灵风和陈玄风都喜欢梅超风。
而梅超风喜欢的却是二师兄陈玄风，他们瞒着黄药师，私定终身，结果，他们的秘密被心生嫉妒的曲灵风发现。
据梅超风说，那一晚她跟陈玄风两个人正卿卿我我，你侬我侬，突然曲灵风出现在窗外，大声叫唤，说要把他们的丑事告诉黄药师。
原来曲灵风曾经偷听黄药师跟梅超风谈话，梅超风说要一辈子跟着黄药师，不离开桃花岛，黄药师一高兴，要把自己最厉害的弹指神通传给梅超风。
曲灵风本来喜欢梅超风，听了梅超风跟黄药师的这段对话，误以为黄药师也喜欢梅超风，就打着黄药师的旗号，去质问梅超风和陈玄风，说梅超风背叛了黄药师。
其实是曲灵风因为吃了醋，无处发泄，又拿梅超风和陈玄风没办法，就搬出黄药师压他们。
结果陈玄风和曲灵风大打出手，曲灵风是大师兄，武功在黄药师弟子里最高，陈玄风不一会就被打趴下，梅超风赶紧趴在陈玄风身上护着他，最终把曲灵风气走了，说要去告诉黄药师。
陈玄风和梅超风已经有了夫妻之实，还是瞒着黄药师做下的，二人知道黄药师武功极高，又心狠手辣，尤其是他的附骨针，能折磨得人求生不得求死不能，便逃出了桃花岛、
在逃走以前，二人偷走了黄药师的九阴真经下卷。
所以，一开始的时候，黄药师特别痛恨自己的这两个徒弟，由于他们两个偷走九阴真经，连累黄蓉之母难产而死，黄药师找不到陈梅，迁怒其他弟子，将他们挑断脚筋，打断双腿，逐出了师门。
在牛家村，全真七子靠着天罡北斗阵，打伤梅超风，黄药师虽然痛恨自己这个徒弟，但是他生性最爱护短，自己的弟子，自己打断腿，甚至打死，都没事，别人不能动她一根汗毛。
不久前在陆乘风的归云庄里，郭靖靠着洪七公的降龙十八掌缺三掌，打败了梅超风，黄药师就受不了别人打败自己的弟子，用弹指神通帮助梅超风打伤郭靖，之后又亲自出手摔了郭靖好大一个跟头。
所以黄药师即便再痛恨自己的徒弟梅超风，也决不允许别人欺负她，特别是马钰、丘处机、王处一等全真七子以多欺少。
于是黄药师出手救了梅超风，大战全真七子的天罡北斗阵，然而，黄药师却忘了窥伺在一旁的西毒欧阳锋。
黄药师刚出手时很轻视全真七子的天罡北斗阵，等打了起来，进入阵中，才知道自己小觑了全真祖师王重阳，这天罡北斗阵是王重阳晚年耗尽无数精力研究出来的，黄药师拼尽全力只跟全真七子打了个平手。
这时候，欧阳锋窥伺在旁，他号称西毒，做事心狠手辣，全不管什么江湖规矩，马上就要举行第二次华山论剑了，黄药师是个劲敌，于是欧阳锋心生歹毒，要在黄药师无暇防备的时候，从背后偷袭黄药师，意图一举把黄药师一掌打成重伤甚至打死。
这时候，梅超风突然飞了过来，扑到黄药师背后，接了欧阳锋这无坚不摧的一掌蛤蟆功，救了黄药师一命。
黄药师原先确实喜欢自己这个女徒弟，但是不是男女那种喜欢，而是把梅超风当作女儿一般的喜欢，再加上梅超风生的好看——黄药师绝对是个颜值党，又聪明伶俐，惹人怜爱，对梅超风甚为宠溺。
所以梅超风逃出桃花岛，跟陈玄风偷走九阴真经，累得黄蓉母亲难产，她一直对黄药师愧疚于心。
因此梅超风一直想回桃花岛，想重新拜在黄药师门下，以至于她屡次搭救黄蓉，甚至为了黄蓉大战欧阳克、灵智上人、沙通天、彭连虎等人。
这一次，梅超风看恩师有难，便奋不顾身，以自己的身躯，硬是接了欧阳锋的蛤蟆功。
欧阳锋的蛤蟆功可是非同小可，跟洪七公的降龙十八掌、一灯大师的一阳、黄药师的弹指神通并驾齐驱，旗鼓相当。
这次欧阳锋又是拼尽全力，用了十成功力，想要一击便结果了黄药师性命，梅超风挨了这一下，岂能活命？
只是欧阳锋一看没杀成黄药师，不免有点遗憾，再加上他害怕全真七子联手黄药师，自己不是对手，赶紧逃跑了，因为全真七子之一的谭处端也被欧阳锋偷袭打死了。
梅超风死后，黄药师找到在曲灵风密室里疗伤的郭靖黄蓉，心中非常高兴，便说要去找欧阳锋、灵智上人、杨康、裘千仞等人报仇，还让郭靖黄蓉跟着去看热闹。
话说，黄药师为何要找其他几个人报仇？因为灵智上人在大海上骗过黄药师，说黄蓉已经死了，累得黄药师伤心痛哭，而裘千丈假扮裘千仞，说黄药师打死了洪七公，至于杨康，带着完颜洪烈王府那帮人，欺负过黄蓉。
可是，正在黄药师要去报仇的时候，江南六怪之首的柯镇恶柯大侠，突然要泄露郭靖一个天大的秘密，结果这个秘密惹怒了黄药师，捅了大篓子，黄药师一生气，就不提报仇的事儿了。
柯镇恶差点泄露郭靖的秘密，导致黄药师不提报仇的事儿了。
欧阳锋打死了梅超风，以及全真七子里的谭处端，害怕双方联手，自己不是对手，便逃之夭夭了。
之后，黄药师见徒弟死了，心中没有好气，全真七子死了一个，他暂时跟全真七子罢手，可是此时江南七怪正好找来。
黄药师这个人，不但生性最好护短，还喜欢迁怒于人，他知道江南七怪是梅超风的死对头，不但梅超风的两只眼睛是柯大侠弄瞎的，他的二徒弟陈玄风也是死在江南七怪的徒弟郭靖的手里的。
于是黄药师迁怒江南七怪，抱着梅超风的尸体，把梅超风的尸体当武器，要让梅超风的尸体亲自打死江南七怪。
结果郭靖在密室里一看师父有难，就打破密室墙壁，想救师父，然后黄药师一看女儿黄蓉还活着，便放下梅超风，帮助黄蓉给郭靖疗伤。
黄药师听黄蓉讲了半个时辰这段时间的经历，便知道自己冤枉了江南七怪，原来黄药师本来就要杀江南七怪，因为他认为是郭靖带累得自己的女儿死在大海上的。
黄蓉让黄药师给江南七怪道歉，黄药师是一派大宗师，怎么会给江南七怪赔不是，便岔开话题，说要去找欧阳锋、灵智上人、裘千丈裘千仞、杨康等人报仇，还让郭靖黄蓉一起去看热闹。
结果，正在他们要去报仇的时候，柯镇恶突然要说出郭靖的一个大秘密。
原来柯镇恶此人，最是讲江湖规矩的，黄药师看黄蓉没死，重新认了郭靖当女婿，江南七怪本来替郭靖高兴，可是柯镇恶突然想到，郭靖已经跟蒙古公主华筝有了婚约，做了成吉思汗的金刀驸马，又怎么能娶黄蓉呢？
就算古代男人三妻四妾，郭靖既娶了黄蓉，又娶了华筝公主，谁做正房夫人，谁做侧室夫人呢？
华筝是正经的蒙古公主，一代天骄成吉思汗的女儿，总不能做个小妾吧？而黄蓉是一代宗师黄药师的宝贝闺女，又是郭靖的真爱，让黄蓉做小的，也不合适。
柯镇恶是个耿直的人，总觉得这件事很不妥当，便想说出来，又怕黄药师一听发怒，憋了回去。
只是柯镇恶料想，这黄药师性情古怪，号称东邪，他听了肯定会觉得，郭靖已经跟蒙古公主有了婚约，还让老叫化洪七公到桃花岛求亲，这不是欺骗蒙蔽玩儿咱们父女俩吗？黄药师定然饶不了郭靖。
然而，柯镇恶终究觉得这件事不能瞒着黄药师，便在心中思考怎么措辞说明白，结果后来，他还没说，却终究让黄药师知道了。
原来华筝和拖雷也来到了中原，黄药师自然就知道了，果然不出柯镇恶所料，黄药师不但要杀郭靖，还要杀了华筝，最终被黄蓉阻拦。
黄药师气不打一处来，虽然女儿死心塌地要跟着郭靖，嫁给郭靖，而是黄药师总是咽不下这口气，便不再提找欧阳锋报仇的事儿了。
欧阳锋逆练九阴真经大功告成，武功高过黄药师，黄药师有点欺软怕硬，不再找欧阳锋报仇。
欧阳锋当真是个武学奇才，原来他跟黄药师也就是半斤八两，谁知道他竟然逆转经脉，逆练九阴真经成功，武功高过了黄药师。
第二次华山论剑，欧阳锋以一敌三，打败了黄药师、洪七公和郭靖，黄药师不得不承认，自己已经不是欧阳锋的敌手。
在此之前，二人最多半斤八两，多次交手都未分胜负。
第一次华山论剑，欧阳锋用蛤蟆功跟黄药师的弹指神通打成平手，在桃花岛，欧阳锋以铁铮跟黄药师的玉箫又打成平手，欧阳锋认为，他跟黄药师就算打个一两千招，仍然是难分胜负。
可是，欧阳锋逼迫黄蓉和郭靖给他解释九阴真经，竟然练成了逆转九阴假经，武功突飞猛进。
黄药师的弹指神通已经不是他的对手，被欧阳锋咬坏了手指，败下阵来，就算洪七公和黄药师联手，堪堪也只是打平了欧阳锋，以二敌一，胜之不武。
从此黄药师虽不能说怕了疯疯癫癫的欧阳锋，却比以前更加忌惮，所以他一个人不敢去找欧阳锋复仇。
他口口声声找欧阳锋、裘千仞、灵智上人报仇，结果一个都没找，反而是屡次欺负武功低微的江南七怪。
黄药师这个人，实在有点欺软怕硬，说到骨气，还不如柯镇恶柯老侠。
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